Номер извещения: 0373100010326000014

Общая информация о закупке

Внимание! За нарушение требований антимонопольного законодательства Российской Федерации о запрете участия в ограничивающих конкуренцию соглашениях, осуществления ограничивающих конкуренцию согласованных действий предусмотрена ответственность в соответствии со ст. 14.32 КоАП РФ и ст. 178 УК РФ

Способ определения поставщика (подрядчика, исполнителя): Электронный аукцион

Наименование электронной площадки в информационно-телекоммуникационной сети «Интернет»: РТС-тендер

Адрес электронной площадки в информационно-телекоммуникационной сети «Интернет»: http://www.rts-tender.ru

Размещение осуществляет: Заказчик ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ИНСТИТУТ ПРОБЛЕМ ЭКОЛОГИИ И ЭВОЛЮЦИИ ИМ. А.Н. СЕВЕРЦОВА РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК

Наименование объекта закупки: Выполнение работ по выделению ДНК и секвенированию в рамках молекулярно-генетических исследований ИПЭЭ РАН

Этап закупки: Подача заявок

Сведения о связи с позицией плана-графика: 202603731000103001000059

Контактная информация

Размещение осуществляет: Заказчик

Организация, осуществляющая размещение: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ИНСТИТУТ ПРОБЛЕМ ЭКОЛОГИИ И ЭВОЛЮЦИИ ИМ. А.Н. СЕВЕРЦОВА РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК

Почтовый адрес: 119071, москва, москва город, ленинский проспект улица, дом 33

Место нахождения: Российская Федерация, 119071, Москва г, Ленинский пр-кт, Д.33

Ответственное должностное лицо: Баранов Ю. Н.

Адрес электронной почты: zakupki@sev-in.ru

Номер контактного телефона: 7-495-9543262

Дополнительная информация: Информация отсутствует

Регион: Москва

Информация о процедуре закупки

Дата и время начала срока подачи заявок: 18.08.2026 13:59 (МСК)

Дата и время окончания срока подачи заявок: 26.08.2026 10:00 (МСК)

Дата проведения процедуры подачи предложений о цене контракта либо о сумме цен единиц товара, работы, услуги: 26.08.2026

Дата подведения итогов определения поставщика (подрядчика, исполнителя): 27.08.2026

Начальная (максимальная) цена контракта

Начальная (максимальная) цена контракта: 16 719 185,60

Валюта: РОССИЙСКИЙ РУБЛЬ

Идентификационный код закупки (ИКЗ): 261772500980777250100100340017219244

Информация о сроках исполнения контракта и источниках финансирования

Срок исполнения контракта (отдельных этапов исполнения контракта) включает в том числе приемку поставленного товара, выполненной работы, оказанной услуги, а также оплату заказчиком поставщику (подрядчику, исполнителю) поставленного товара, выполненной работы, оказанной услуги

Дата начала исполнения контракта: с даты заключения контракта

Срок исполнения контракта: 31.12.2026

Закупка за счет собственных средств организации: Да

Информация об объекте закупки

Код позиции - Наименование товара, работы, услуги - Ед. измерения - Количество (объем работы, услуги) - Цена за ед., ? - Стоимость, ?

- 72.19.16.000 - Подготовка библиотек и секвенирование образцов средовой ДНК (ПЦР одной парой праймеров, прочтения 150РЕ), 80 тыс прочтений на образец Заказчиком предоставляются образцы средовой ДНК 2200 Качество выделенной ДНК Соотношение поглощений А260/А280 - 1,8-2,0 Контроль качества ДНК Спектрофотометрия (прибор типа NanoDrop), электрофорез в агарозном геле, флуорометрия (Qubit); передача Заказчику отчета с поглощениями при 260/280 нм, электрофореграммами, выходом и концентрацией ДНК - Условная единица - 2 200,00 - 3 386,00 - 7 449 200,00

- Наименование характеристики Значение характеристики Единица измерения характеристики Инструкция по заполнению характеристик в заявке Заказчиком предоставляются образцы средовой ДНК 2200 Значение характеристики не может изменяться участником закупки Качество выделенной ДНК Соотношение поглощений А260/А280 - 1,8-2,0 Значение характеристики не может изменяться участником закупки Контроль качества ДНК Спектрофотометрия (прибор типа NanoDrop), электрофорез в агарозном геле, флуорометрия (Qubit); передача Заказчику отчета с поглощениями при 260/280 нм, электрофореграммами, выходом и концентрацией ДНК Значение характеристики не может изменяться участником закупки Подготовка библиотек ампликонов ПЦР-амплификация целевого фрагмента ДНК каждой пробы одной парой праймеров, синтезированной по предоставленной Заказчиком последовательности; лигирование адаптеров, совместимых с паттернированными проточными ячейками Illumina NovaSeq X Значение характеристики не может изменяться участником закупки Индексирование библиотек Уникальные двойные индексы (UDI) для каждого образца, исключающие перекрестное присвоение прочтений (index hopping) на паттернированных проточных ячейках Значение характеристики не может изменяться участником закупки Секвенирование низкоразнообразных ампликонных библиотек проводится с добавлением спайк-контроля PhiX в доле, рекомендованной производителем платформы для данного типа библиотек (10-20%) Соответствие Значение характеристики не может изменяться участником закупки Контроль качества библиотек Распределение размеров фрагментов (прибор типа Agilent Bioanalyzer или аналогичный), количественная оценка (Qubit или ПЦР в реальном времени); отчет передается Заказчику до начала секвенирования Значение характеристики не может изменяться участником закупки Платформа секвенирования Illumina NovaSeq X / NovaSeq X Plus, химия XLEAP-SBS Значение характеристики не может изменяться участником закупки Режим чтения Парные прочтения 150?150 (2?150 п. н.); суммарная длина парного прочтения обеспечивает перекрытие целевого ампликона Значение характеристики не может изменяться участником закупки Объем данных на образец не менее 80 000 парных прочтений (без учета контрольной библиотеки PhiX) Значение характеристики не может изменяться участником закупки Качество данных секвенирования не менее 85% оснований с качеством не ниже Q30 (в соответствии со спецификацией производителя платформы для режима 2?150) Значение характеристики не может изменяться участником закупки Первичная обработка данных Демультиплексирование и генерация FASTQ средствами Illumina DRAGEN BCL Convert с триммингом адаптеров; сжатие gzip Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Наименование характеристики - Значение характеристики - Единица измерения характеристики - Инструкция по заполнению характеристик в заявке - Заказчиком предоставляются образцы средовой ДНК - 2200 - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Качество выделенной ДНК - Соотношение поглощений А260/А280 - 1,8-2,0 - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Контроль качества ДНК - Спектрофотометрия (прибор типа NanoDrop), электрофорез в агарозном геле, флуорометрия (Qubit); передача Заказчику отчета с поглощениями при 260/280 нм, электрофореграммами, выходом и концентрацией ДНК - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Подготовка библиотек ампликонов - ПЦР-амплификация целевого фрагмента ДНК каждой пробы одной парой праймеров, синтезированной по предоставленной Заказчиком последовательности; лигирование адаптеров, совместимых с паттернированными проточными ячейками Illumina NovaSeq X - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Индексирование библиотек - Уникальные двойные индексы (UDI) для каждого образца, исключающие перекрестное присвоение прочтений (index hopping) на паттернированных проточных ячейках - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Секвенирование низкоразнообразных ампликонных библиотек проводится с добавлением спайк-контроля PhiX в доле, рекомендованной производителем платформы для данного типа библиотек (10-20%) - Соответствие - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Контроль качества библиотек - Распределение размеров фрагментов (прибор типа Agilent Bioanalyzer или аналогичный), количественная оценка (Qubit или ПЦР в реальном времени); отчет передается Заказчику до начала секвенирования - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Платформа секвенирования - Illumina NovaSeq X / NovaSeq X Plus, химия XLEAP-SBS - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Режим чтения - Парные прочтения 150?150 (2?150 п. н.); суммарная длина парного прочтения обеспечивает перекрытие целевого ампликона - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Объем данных на образец - не менее 80 000 парных прочтений (без учета контрольной библиотеки PhiX) - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Качество данных секвенирования - не менее 85% оснований с качеством не ниже Q30 (в соответствии со спецификацией производителя платформы для режима 2?150) - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Первичная обработка данных - Демультиплексирование и генерация FASTQ средствами Illumina DRAGEN BCL Convert с триммингом адаптеров; сжатие gzip - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Наименование характеристики - Значение характеристики - Единица измерения характеристики - Инструкция по заполнению характеристик в заявке

Заказчиком предоставляются образцы средовой ДНК - 2200 - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Качество выделенной ДНК - Соотношение поглощений А260/А280 - 1,8-2,0 - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Контроль качества ДНК - Спектрофотометрия (прибор типа NanoDrop), электрофорез в агарозном геле, флуорометрия (Qubit); передача Заказчику отчета с поглощениями при 260/280 нм, электрофореграммами, выходом и концентрацией ДНК - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Подготовка библиотек ампликонов - ПЦР-амплификация целевого фрагмента ДНК каждой пробы одной парой праймеров, синтезированной по предоставленной Заказчиком последовательности; лигирование адаптеров, совместимых с паттернированными проточными ячейками Illumina NovaSeq X - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Индексирование библиотек - Уникальные двойные индексы (UDI) для каждого образца, исключающие перекрестное присвоение прочтений (index hopping) на паттернированных проточных ячейках - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Секвенирование низкоразнообразных ампликонных библиотек проводится с добавлением спайк-контроля PhiX в доле, рекомендованной производителем платформы для данного типа библиотек (10-20%) - Соответствие - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Контроль качества библиотек - Распределение размеров фрагментов (прибор типа Agilent Bioanalyzer или аналогичный), количественная оценка (Qubit или ПЦР в реальном времени); отчет передается Заказчику до начала секвенирования - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Платформа секвенирования - Illumina NovaSeq X / NovaSeq X Plus, химия XLEAP-SBS - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Режим чтения - Парные прочтения 150?150 (2?150 п. н.); суммарная длина парного прочтения обеспечивает перекрытие целевого ампликона - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Объем данных на образец - не менее 80 000 парных прочтений (без учета контрольной библиотеки PhiX) - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Качество данных секвенирования - не менее 85% оснований с качеством не ниже Q30 (в соответствии со спецификацией производителя платформы для режима 2?150) - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Первичная обработка данных - Демультиплексирование и генерация FASTQ средствами Illumina DRAGEN BCL Convert с триммингом адаптеров; сжатие gzip - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

- 72.19.16.000 - Пробоподготовка (подготовка библиотек) средовой ДНК и секвенирование на платформе PacBio Revio Первичная обработка данных Демультиплексирование по баркодам и экспорт данных средствами ПО SMRT Link (для Kinnex-библиотек - с сегментацией конкатенированных прочтений) Подготовка кольцевых SMRTbell-библиотек из пулов баркодированных ампликонов по актуальному протоколу производителя платформы (SMRTbell prep kit 3.0 или эквивалентный) Соответствие Контроль качества библиотек Количественная оценка (Qubit или эквивалент), контроль распределения длин фрагментов методом капиллярного электрофореза (прибор типа Agilent Bioanalyzer/Femto Pulse или аналогичный); отчет передается Заказчику до начала секвенирования - Условная катушка - 400,00 - 6 578,33 - 2 631 332,00

- Наименование характеристики Значение характеристики Единица измерения характеристики Инструкция по заполнению характеристик в заявке Первичная обработка данных Демультиплексирование по баркодам и экспорт данных средствами ПО SMRT Link (для Kinnex-библиотек - с сегментацией конкатенированных прочтений) Значение характеристики не может изменяться участником закупки Подготовка кольцевых SMRTbell-библиотек из пулов баркодированных ампликонов по актуальному протоколу производителя платформы (SMRTbell prep kit 3.0 или эквивалентный) Соответствие Значение характеристики не может изменяться участником закупки Контроль качества библиотек Количественная оценка (Qubit или эквивалент), контроль распределения длин фрагментов методом капиллярного электрофореза (прибор типа Agilent Bioanalyzer/Femto Pulse или аналогичный); отчет передается Заказчику до начала секвенирования Значение характеристики не может изменяться участником закупки Платформа секвенирования PacBio Revio, ячейки Revio SMRT Cell (25 млн ZMW-ячеек) Значение характеристики не может изменяться участником закупки Режим секвенирования Кольцевое консенсусное секвенирование (CCS) с получением высокоточных HiFi-прочтений Значение характеристики не может изменяться участником закупки Точность HiFi-прочтений Предсказанная точность каждого прочтения не ниже Q20 (99%); медианная точность прочтений не ниже Q30 Значение характеристики не может изменяться участником закупки Длина прочтений HiFi-прочтения полностью перекрывают целевой ампликон, включая ампликоны длиной ~1,5-2 тыс. п. н. (поддерживаемый диапазон HiFi - 1-25 тыс. п. н.) Значение характеристики не может изменяться участником закупки Объем данных на образец не менее 10 000 HiFi-прочтений Значение характеристики не может изменяться участником закупки Заказчиком предоставляются образцы средовой ДНК 400 Значение характеристики не может изменяться участником закупки Контроль качества ДНК Спектрофотометрия (прибор типа NanoDrop), флуорометрия (Qubit); передача Заказчику отчета о концентрации и чистоте ДНК в образцах Значение характеристики не может изменяться участником закупки Подготовка библиотек полноразмерных ампликонов для длинных прочтений ПЦР-амплификация полноразмерных целевых маркерных фрагментов ДНК каждой пробы парами праймеров по предоставленным Заказчиком последовательностям (например, полноразмерный ген 16S рРНК - праймеры типа 27F/1492R, ~1,5 тыс. п. н.; ген 18S рРНК - EukA/EukB; ITS-регион - ITS1F/ITS4) с использованием баркодированных праймеров или баркодированных адаптеров Значение характеристики не может изменяться участником закупки Мультиплексирование Индивидуальное баркодирование каждого образца; объединение баркодированных ампликонов в пулы в соответствии с актуальными протоколами производителя платформы (до 192 образцов на ячейку при стандартном протоколе; допускается использование технологии конкатенации ампликонов Kinnex, в том числе Kinnex 16S rRNA kit, с мультиплексированием до 384-1536 образцов на ячейку) Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Наименование характеристики - Значение характеристики - Единица измерения характеристики - Инструкция по заполнению характеристик в заявке - Первичная обработка данных - Демультиплексирование по баркодам и экспорт данных средствами ПО SMRT Link (для Kinnex-библиотек - с сегментацией конкатенированных прочтений) - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Подготовка кольцевых SMRTbell-библиотек из пулов баркодированных ампликонов по актуальному протоколу производителя платформы (SMRTbell prep kit 3.0 или эквивалентный) - Соответствие - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Контроль качества библиотек - Количественная оценка (Qubit или эквивалент), контроль распределения длин фрагментов методом капиллярного электрофореза (прибор типа Agilent Bioanalyzer/Femto Pulse или аналогичный); отчет передается Заказчику до начала секвенирования - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Платформа секвенирования - PacBio Revio, ячейки Revio SMRT Cell (25 млн ZMW-ячеек) - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Режим секвенирования - Кольцевое консенсусное секвенирование (CCS) с получением высокоточных HiFi-прочтений - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Точность HiFi-прочтений - Предсказанная точность каждого прочтения не ниже Q20 (99%); медианная точность прочтений не ниже Q30 - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Длина прочтений - HiFi-прочтения полностью перекрывают целевой ампликон, включая ампликоны длиной ~1,5-2 тыс. п. н. (поддерживаемый диапазон HiFi - 1-25 тыс. п. н.) - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Объем данных на образец - не менее 10 000 HiFi-прочтений - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Заказчиком предоставляются образцы средовой ДНК - 400 - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Контроль качества ДНК - Спектрофотометрия (прибор типа NanoDrop), флуорометрия (Qubit); передача Заказчику отчета о концентрации и чистоте ДНК в образцах - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Подготовка библиотек полноразмерных ампликонов для длинных прочтений - ПЦР-амплификация полноразмерных целевых маркерных фрагментов ДНК каждой пробы парами праймеров по предоставленным Заказчиком последовательностям (например, полноразмерный ген 16S рРНК - праймеры типа 27F/1492R, ~1,5 тыс. п. н.; ген 18S рРНК - EukA/EukB; ITS-регион - ITS1F/ITS4) с использованием баркодированных праймеров или баркодированных адаптеров - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Мультиплексирование - Индивидуальное баркодирование каждого образца; объединение баркодированных ампликонов в пулы в соответствии с актуальными протоколами производителя платформы (до 192 образцов на ячейку при стандартном протоколе; допускается использование технологии конкатенации ампликонов Kinnex, в том числе Kinnex 16S rRNA kit, с мультиплексированием до 384-1536 образцов на ячейку) - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Наименование характеристики - Значение характеристики - Единица измерения характеристики - Инструкция по заполнению характеристик в заявке

Первичная обработка данных - Демультиплексирование по баркодам и экспорт данных средствами ПО SMRT Link (для Kinnex-библиотек - с сегментацией конкатенированных прочтений) - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Подготовка кольцевых SMRTbell-библиотек из пулов баркодированных ампликонов по актуальному протоколу производителя платформы (SMRTbell prep kit 3.0 или эквивалентный) - Соответствие - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Контроль качества библиотек - Количественная оценка (Qubit или эквивалент), контроль распределения длин фрагментов методом капиллярного электрофореза (прибор типа Agilent Bioanalyzer/Femto Pulse или аналогичный); отчет передается Заказчику до начала секвенирования - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Платформа секвенирования - PacBio Revio, ячейки Revio SMRT Cell (25 млн ZMW-ячеек) - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Режим секвенирования - Кольцевое консенсусное секвенирование (CCS) с получением высокоточных HiFi-прочтений - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Точность HiFi-прочтений - Предсказанная точность каждого прочтения не ниже Q20 (99%); медианная точность прочтений не ниже Q30 - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Длина прочтений - HiFi-прочтения полностью перекрывают целевой ампликон, включая ампликоны длиной ~1,5-2 тыс. п. н. (поддерживаемый диапазон HiFi - 1-25 тыс. п. н.) - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Объем данных на образец - не менее 10 000 HiFi-прочтений - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Заказчиком предоставляются образцы средовой ДНК - 400 - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Контроль качества ДНК - Спектрофотометрия (прибор типа NanoDrop), флуорометрия (Qubit); передача Заказчику отчета о концентрации и чистоте ДНК в образцах - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Подготовка библиотек полноразмерных ампликонов для длинных прочтений - ПЦР-амплификация полноразмерных целевых маркерных фрагментов ДНК каждой пробы парами праймеров по предоставленным Заказчиком последовательностям (например, полноразмерный ген 16S рРНК - праймеры типа 27F/1492R, ~1,5 тыс. п. н.; ген 18S рРНК - EukA/EukB; ITS-регион - ITS1F/ITS4) с использованием баркодированных праймеров или баркодированных адаптеров - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Мультиплексирование - Индивидуальное баркодирование каждого образца; объединение баркодированных ампликонов в пулы в соответствии с актуальными протоколами производителя платформы (до 192 образцов на ячейку при стандартном протоколе; допускается использование технологии конкатенации ампликонов Kinnex, в том числе Kinnex 16S rRNA kit, с мультиплексированием до 384-1536 образцов на ячейку) - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

- 72.19.16.000 - Пробоподготовка (выделение ДНК, подготовка библиотек) и полногеномное секвенирование (150?150 парное чтение), объем данных: 12 Гб на образец Платформа секвенирования Illumina NovaSeq X / NovaSeq X Plus, химия XLEAP-SBS, проточные ячейки серии 1.5B/5B/10B/25B Режим чтения парные прочтения 150?150 (2?150 п. н.) Объем данных на образец ? 12 - Условная единица - 100,00 - 25 630,00 - 2 563 000,00

- Наименование характеристики Значение характеристики Единица измерения характеристики Инструкция по заполнению характеристик в заявке Платформа секвенирования Illumina NovaSeq X / NovaSeq X Plus, химия XLEAP-SBS, проточные ячейки серии 1.5B/5B/10B/25B Значение характеристики не может изменяться участником закупки Режим чтения парные прочтения 150?150 (2?150 п. н.) Объем данных на образец ? 12 Гигабайт Значение характеристики не может изменяться участником закупки Качество данных секвенирования не менее 85% оснований с качеством не ниже Q30 (в соответствии со спецификацией производителя платформы для режима 2?150) Значение характеристики не может изменяться участником закупки Первичная обработка данных демультиплексирование и генерация FASTQ средствами Illumina DRAGEN BCL Convert с триммингом адаптеров; сжатие gzip Значение характеристики не может изменяться участником закупки Заказчиком предоставляются образцы тканей 100 Значение характеристики не может изменяться участником закупки Выход и качество выделенной ДНК из каждого образца не менее 5 мкг высокомолекулярной ДНК (размер фрагментов более 50 кб); соотношение поглощений А260/А280 - 1,8-2,0 Значение характеристики не может изменяться участником закупки Контроль качества ДНК Спектрофотометрия (прибор типа NanoDrop), электрофорез в агарозном геле, флуорометрия (Qubit); передача Заказчику отчета с поглощениями при 260/280 нм, электрофореграммами, выходом и концентрацией ДНК Значение характеристики не может изменяться участником закупки Подготовка библиотек по стандартному протоколу полногеномного секвенирования (shotgun) Случайная фрагментация геномной ДНК (ультразвуковая или ферментативная) до ~300-400 п. н., лигирование адаптеров, совместимых с паттернированными проточными ячейками Illumina NovaSeq X, ПЦР-амплификация Значение характеристики не может изменяться участником закупки Индексирование библиотек Уникальные двойные индексы (UDI) для каждого образца, исключающие перекрестное присвоение прочтений (index hopping) на паттернированных проточных ячейках Значение характеристики не может изменяться участником закупки Контроль качества библиотек Распределение размеров фрагментов (прибор типа Agilent Bioanalyzer или аналогичный), количественная оценка (Qubit или ПЦР в реальном времени); отчет передается Заказчику до начала секвенирования Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Наименование характеристики - Значение характеристики - Единица измерения характеристики - Инструкция по заполнению характеристик в заявке - Платформа секвенирования - Illumina NovaSeq X / NovaSeq X Plus, химия XLEAP-SBS, проточные ячейки серии 1.5B/5B/10B/25B - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Режим чтения - парные прочтения 150?150 (2?150 п. н.) - - - Объем данных на образец - ? 12 - Гигабайт - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Качество данных секвенирования - не менее 85% оснований с качеством не ниже Q30 (в соответствии со спецификацией производителя платформы для режима 2?150) - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Первичная обработка данных - демультиплексирование и генерация FASTQ средствами Illumina DRAGEN BCL Convert с триммингом адаптеров; сжатие gzip - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Заказчиком предоставляются образцы тканей - 100 - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Выход и качество выделенной ДНК из каждого образца - не менее 5 мкг высокомолекулярной ДНК (размер фрагментов более 50 кб); соотношение поглощений А260/А280 - 1,8-2,0 - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Контроль качества ДНК - Спектрофотометрия (прибор типа NanoDrop), электрофорез в агарозном геле, флуорометрия (Qubit); передача Заказчику отчета с поглощениями при 260/280 нм, электрофореграммами, выходом и концентрацией ДНК - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Подготовка библиотек по стандартному протоколу полногеномного секвенирования (shotgun) - Случайная фрагментация геномной ДНК (ультразвуковая или ферментативная) до ~300-400 п. н., лигирование адаптеров, совместимых с паттернированными проточными ячейками Illumina NovaSeq X, ПЦР-амплификация - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Индексирование библиотек - Уникальные двойные индексы (UDI) для каждого образца, исключающие перекрестное присвоение прочтений (index hopping) на паттернированных проточных ячейках - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Контроль качества библиотек - Распределение размеров фрагментов (прибор типа Agilent Bioanalyzer или аналогичный), количественная оценка (Qubit или ПЦР в реальном времени); отчет передается Заказчику до начала секвенирования - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Наименование характеристики - Значение характеристики - Единица измерения характеристики - Инструкция по заполнению характеристик в заявке

Платформа секвенирования - Illumina NovaSeq X / NovaSeq X Plus, химия XLEAP-SBS, проточные ячейки серии 1.5B/5B/10B/25B - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Режим чтения - парные прочтения 150?150 (2?150 п. н.) - -

Объем данных на образец - ? 12 - Гигабайт - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Качество данных секвенирования - не менее 85% оснований с качеством не ниже Q30 (в соответствии со спецификацией производителя платформы для режима 2?150) - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Первичная обработка данных - демультиплексирование и генерация FASTQ средствами Illumina DRAGEN BCL Convert с триммингом адаптеров; сжатие gzip - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Заказчиком предоставляются образцы тканей - 100 - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Выход и качество выделенной ДНК из каждого образца - не менее 5 мкг высокомолекулярной ДНК (размер фрагментов более 50 кб); соотношение поглощений А260/А280 - 1,8-2,0 - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Контроль качества ДНК - Спектрофотометрия (прибор типа NanoDrop), электрофорез в агарозном геле, флуорометрия (Qubit); передача Заказчику отчета с поглощениями при 260/280 нм, электрофореграммами, выходом и концентрацией ДНК - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Подготовка библиотек по стандартному протоколу полногеномного секвенирования (shotgun) - Случайная фрагментация геномной ДНК (ультразвуковая или ферментативная) до ~300-400 п. н., лигирование адаптеров, совместимых с паттернированными проточными ячейками Illumina NovaSeq X, ПЦР-амплификация - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Индексирование библиотек - Уникальные двойные индексы (UDI) для каждого образца, исключающие перекрестное присвоение прочтений (index hopping) на паттернированных проточных ячейках - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Контроль качества библиотек - Распределение размеров фрагментов (прибор типа Agilent Bioanalyzer или аналогичный), количественная оценка (Qubit или ПЦР в реальном времени); отчет передается Заказчику до начала секвенирования - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

- 72.19.16.000 - Подготовка библиотек и полногеномное секвенирование ДНК (парные прочтения 150РЕ), 100 Гб данных на образец Выход и качество выделенной ДНК из каждого образца не менее 5 мкг высокомолекулярной ДНК (размер фрагментов более 50 кб); соотношение поглощений А260/А280 - 1,8-2,0 Контроль качества ДНК Спектрофотометрия (прибор типа NanoDrop), электрофорез в агарозном геле, флуорометрия (Qubit); передача Заказчику отчета с поглощениями при 260/280 нм, электрофореграммами, выходом и концентрацией ДНК Подготовка библиотек по стандартному протоколу полногеномного секвенирования (shotgun) Случайная фрагментация геномной ДНК (ультразвуковая или ферментативная) до ~300-400 п. н., лигирование адаптеров, совместимых с паттернированными проточными ячейками Illumina NovaSeq X, ПЦР-амплификация - Условная единица - 80,00 - 50 945,67 - 4 075 653,60

- Наименование характеристики Значение характеристики Единица измерения характеристики Инструкция по заполнению характеристик в заявке Выход и качество выделенной ДНК из каждого образца не менее 5 мкг высокомолекулярной ДНК (размер фрагментов более 50 кб); соотношение поглощений А260/А280 - 1,8-2,0 Значение характеристики не может изменяться участником закупки Контроль качества ДНК Спектрофотометрия (прибор типа NanoDrop), электрофорез в агарозном геле, флуорометрия (Qubit); передача Заказчику отчета с поглощениями при 260/280 нм, электрофореграммами, выходом и концентрацией ДНК Значение характеристики не может изменяться участником закупки Подготовка библиотек по стандартному протоколу полногеномного секвенирования (shotgun) Случайная фрагментация геномной ДНК (ультразвуковая или ферментативная) до ~300-400 п. н., лигирование адаптеров, совместимых с паттернированными проточными ячейками Illumina NovaSeq X, ПЦР-амплификация Значение характеристики не может изменяться участником закупки Индексирование библиотек Уникальные двойные индексы (UDI) для каждого образца, исключающие перекрестное присвоение прочтений (index hopping) на паттернированных проточных ячейках Значение характеристики не может изменяться участником закупки Контроль качества библиотек Распределение размеров фрагментов (прибор типа Agilent Bioanalyzer или аналогичный), количественная оценка (Qubit или ПЦР в реальном времени); отчет передается Заказчику до начала секвенирования Значение характеристики не может изменяться участником закупки Заказчиком предоставляются образцы тканей 80 Значение характеристики не может изменяться участником закупки Платформа секвенирования Illumina NovaSeq X / NovaSeq X Plus, химия XLEAP-SBS, проточные ячейки серии 1.5B/5B/10B/25B Значение характеристики не может изменяться участником закупки Режим чтения парные прочтения 150?150 (2?150 п. н.) Значение характеристики не может изменяться участником закупки Объем данных на образец ? 100 Гигабайт Значение характеристики не может изменяться участником закупки Качество данных секвенирования не менее 85% оснований с качеством не ниже Q30 (в соответствии со спецификацией производителя платформы для режима 2?150) Значение характеристики не может изменяться участником закупки Первичная обработка данных демультиплексирование и генерация FASTQ средствами Illumina DRAGEN BCL Convert с триммингом адаптеров; сжатие gzip Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Наименование характеристики - Значение характеристики - Единица измерения характеристики - Инструкция по заполнению характеристик в заявке - Выход и качество выделенной ДНК из каждого образца - не менее 5 мкг высокомолекулярной ДНК (размер фрагментов более 50 кб); соотношение поглощений А260/А280 - 1,8-2,0 - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Контроль качества ДНК - Спектрофотометрия (прибор типа NanoDrop), электрофорез в агарозном геле, флуорометрия (Qubit); передача Заказчику отчета с поглощениями при 260/280 нм, электрофореграммами, выходом и концентрацией ДНК - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Подготовка библиотек по стандартному протоколу полногеномного секвенирования (shotgun) - Случайная фрагментация геномной ДНК (ультразвуковая или ферментативная) до ~300-400 п. н., лигирование адаптеров, совместимых с паттернированными проточными ячейками Illumina NovaSeq X, ПЦР-амплификация - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Индексирование библиотек - Уникальные двойные индексы (UDI) для каждого образца, исключающие перекрестное присвоение прочтений (index hopping) на паттернированных проточных ячейках - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Контроль качества библиотек - Распределение размеров фрагментов (прибор типа Agilent Bioanalyzer или аналогичный), количественная оценка (Qubit или ПЦР в реальном времени); отчет передается Заказчику до начала секвенирования - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Заказчиком предоставляются образцы тканей - 80 - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Платформа секвенирования - Illumina NovaSeq X / NovaSeq X Plus, химия XLEAP-SBS, проточные ячейки серии 1.5B/5B/10B/25B - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Режим чтения - парные прочтения 150?150 (2?150 п. н.) - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Объем данных на образец - ? 100 - Гигабайт - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Качество данных секвенирования - не менее 85% оснований с качеством не ниже Q30 (в соответствии со спецификацией производителя платформы для режима 2?150) - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки - Первичная обработка данных - демультиплексирование и генерация FASTQ средствами Illumina DRAGEN BCL Convert с триммингом адаптеров; сжатие gzip - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Наименование характеристики - Значение характеристики - Единица измерения характеристики - Инструкция по заполнению характеристик в заявке

Выход и качество выделенной ДНК из каждого образца - не менее 5 мкг высокомолекулярной ДНК (размер фрагментов более 50 кб); соотношение поглощений А260/А280 - 1,8-2,0 - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Контроль качества ДНК - Спектрофотометрия (прибор типа NanoDrop), электрофорез в агарозном геле, флуорометрия (Qubit); передача Заказчику отчета с поглощениями при 260/280 нм, электрофореграммами, выходом и концентрацией ДНК - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Подготовка библиотек по стандартному протоколу полногеномного секвенирования (shotgun) - Случайная фрагментация геномной ДНК (ультразвуковая или ферментативная) до ~300-400 п. н., лигирование адаптеров, совместимых с паттернированными проточными ячейками Illumina NovaSeq X, ПЦР-амплификация - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Индексирование библиотек - Уникальные двойные индексы (UDI) для каждого образца, исключающие перекрестное присвоение прочтений (index hopping) на паттернированных проточных ячейках - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Контроль качества библиотек - Распределение размеров фрагментов (прибор типа Agilent Bioanalyzer или аналогичный), количественная оценка (Qubit или ПЦР в реальном времени); отчет передается Заказчику до начала секвенирования - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Заказчиком предоставляются образцы тканей - 80 - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Платформа секвенирования - Illumina NovaSeq X / NovaSeq X Plus, химия XLEAP-SBS, проточные ячейки серии 1.5B/5B/10B/25B - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Режим чтения - парные прочтения 150?150 (2?150 п. н.) - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Объем данных на образец - ? 100 - Гигабайт - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Качество данных секвенирования - не менее 85% оснований с качеством не ниже Q30 (в соответствии со спецификацией производителя платформы для режима 2?150) - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Первичная обработка данных - демультиплексирование и генерация FASTQ средствами Illumina DRAGEN BCL Convert с триммингом адаптеров; сжатие gzip - - Значение характеристики не может изменяться участником закупки

Преимущества, требования к участникам

Преимущества: Преимущество в соответствии с ч. 3 ст. 30 Закона № 44-ФЗ - Размер преимущества не установлен

Требования к участникам: 1. Единые требования к участникам закупок в соответствии с ч. 1 ст. 31 Закона № 44-ФЗ 2. Требования к участникам закупок в соответствии с ч. 1.1 ст. 31 Закона № 44-ФЗ

Обеспечение заявки

Требуется обеспечение заявки: Да

Размер обеспечения заявки: 167 191,86 Российский рубль

Порядок внесения денежных средств в качестве обеспечения заявки на участие в закупке, а также условия гарантии: В соответствии со статьями 44, 45 Федерального закона от 05.04.2013 N 44-ФЗ "О контрактной системе в сфере закупок товаров, работ, услуг для обеспечения государственных и муниципальных нужд"

Реквизиты счета для учета операций со средствами, поступающими заказчику: p/c 03214643000000017300, л/c 20736У14710, БИК 004525988, ОКЦ № 1 ГУ Банка России по ЦФО//УФК ПО Г. МОСКВЕ, г Москва, к/c 40102810545370000003

Реквизиты счета для перечисления денежных средств в случае, предусмотренном ч.13 ст. 44 Закона № 44-ФЗ (в соответствующий бюджет бюджетной системы Российской Федерации): Получатель Номер единого казначейского счета Номер казначейского счета БИК ТОФК УПРАВЛЕНИЕ ФЕДЕРАЛЬНОГО КАЗНАЧЕЙСТВА ПО Г. МОСКВЕ (ИПЭЭ РАН) () ИНН: 7725009807 КПП: 772501001 КБК: 18211610001010000140 ОКТМО: 45915000 40102810545370000003 03100643000000017300 004525988

Условия контракта

Место поставки товара, выполнения работы или оказания услуги: Российская Федерация, г. Москва, вн.тер.г. муниципальный округ Донской, пр-кт Ленинский, д. 33

Обеспечение исполнения контракта

Требуется обеспечение исполнения контракта: Да

Размер обеспечения исполнения контракта: 5 %

Порядок предоставления обеспечения исполнения контракта, требования к обеспечению: Контракт заключается после предоставления заказчику обеспечения исполнения контракта. Обеспечение исполнения контракта может быть представлено в виде безотзывной независимой гарантии или внесением денежных средств на указанный заказчиком счет, на котором в соответствии с законодательством Российской Федерации учитываются операции со средствами, поступающими заказчику, в размере обеспечения исполнения контракта, указанном в документации о закупках. Безотзывная независимая гарантия должна соответствовать требованиям, установленным Гражданским кодексом Российской Федерации, а также иным законодательством Российской Федерации. Способ обеспечения исполнения контракта определяется участником закупки, с которым заключается контракт, самостоятельно. Срок внесения обеспечения - до момента заключения контракта.

Платежные реквизиты для обеспечения исполнения контракта: p/c 03214643000000017300, л/c 20736У14710, БИК 004525988, ОКЦ № 1 ГУ Банка России по ЦФО//УФК ПО Г. МОСКВЕ, г Москва, к/c 40102810545370000003

Требования к гарантии качества товара, работы, услуги

Требуется гарантия качества товара, работы, услуги: Да

Срок, на который предоставляется гарантия и (или) требования к объему предоставления гарантий качества товара, работы, услуги: не менее 6 (шесть) месяцев с даты приемки результатов работ

Информация о банковском и (или) казначейском сопровождении контракта

Требуется казначейское сопровождение контракта

Тип казначейского сопровождения контракта: Расчеты по контракту подлежат казначейскому сопровождению

Документы

Общая информация

Документы

Журнал событий